בראשית שנות ה-2000 עבר הקיבוץ הפרטה כלכלית. ‏כיום, אחרי שהקיבוץ עבר תמורות רבות במבנהו הארגוני והכלכלי, עדיין קיימים בו ענפי חקלאות (לול, בננות וגידולי שדה שונים) אף שרוב החברים והתושבים מתפרנסים ממגוון מקצועות שונים, בתחום היישוב ומחוצה לו. כמו כן נמצא בקיבוץ מפעל "רשת-או-פלסט", המייצר שקיות פלסטיק ורשתות לשימושים שונים.

היום קיבוץ החותרים הוא קיבוץ מתחדש המאורגן על יסודות של שיתוף הכלל בקניין, של עבודה עצמית ושל שוויון ושיתוף בייצור, בצריכה ובחינוך, המקיים ערבות הדדית בעבור חבריו, בהתאם לתקנות האגודות השיתופיות (ערבות הדדית בקיבוץ, התשס"ו- 2005).

לפני שנה התקבלו לחברות 35 משפחות של בני ובנות משק כחברים חדשים, לראשונה מזה 12 שנה ובימים אלה מתכונן הקיבוץ לקלוט קבוצת חברים חדשה.